Dlaczego GAPDH jest używany w Western Blot? + Przykład

Dlaczego GAPDH jest używany w Western Blot? + Przykład
Anonim

Odpowiedź:

GAPDH jest często używany jako kontrola ładowania.

Wyjaśnienie:

W Western blot często używamy GAPDH jako kontroli ładowania. Oznacza to, że sondując GAPDH możemy sprawdzić, czy mamy obciążone równoważne ilości białek na różnych pasmach blotu.

Przykład użycia - powiedzmy, że mamy chorobę, która naszym zdaniem powoduje podniesienie poziomu określonego białka w komórce. Przygotowalibyśmy próbkę ze „zdrowych” komórek i innej próbki z „chorych” komórek. Następnie załadowalibyśmy równoważne ilości białek obu próbek na żel do Western blot.

Po sondowaniu blotu dla naszego interesującego nas białka stwierdzamy, że w komórkach chorych poziom białka jest rzeczywiście podwyższony (czyli ciemniejszy prążek jest wytwarzany na plamie). Aby udowodnić, że ten wzrost białka jest spowodowany zmianą ekspresji w komórce, zamiast artefaktu ładowania (to znaczy, bardziej dynamiczne pasmo jest spowodowane zmianą ekspresji białka w komórkach, a nie przez przypadkowe ładowanie więcej z próbki „choroby” niż „zdrowej”) sondujemy również plamę GAPDH, aby pokazać, że całkowite poziomy białka są takie same w obu pasach.

W ten sposób pokazujemy, że równoważne białko zostało załadowane w dwóch pasach i że obserwowana zmiana intensywności pasma wynika ze zmian w ekspresji białka dla interesującego białka.