Dlaczego większość cięć enzymami restrykcyjnymi w sekwencji palindromicznej?

Dlaczego większość cięć enzymami restrykcyjnymi w sekwencji palindromicznej?
Anonim

Odpowiedź:

Ponieważ jest bardziej wydajny.

Wyjaśnienie:

Enzymy, takie jak enzymy restrykcyjne, muszą rozpoznać bardzo specyficzną sekwencję, aby wykonać swoje zadanie. Wiąże się z DNA tylko w jednej specyficznej konfiguracji. Szczęśliwie! ponieważ nie chcesz „pacmana”, który tnie DNA w przypadkowych miejscach.

DNA jest dwuniciowy, więc ma „dwie strony”, z którymi enzym może się wiązać. Sekwencja palindromiczna jest taka sama do tyłu i do przodu po obu stronach (patrz rysunek poniżej). Oznacza to, że enzym rozpoznaje sekwencję bez względu na to, z której strony enzym zbliża się do DNA.

Sekwencja palindromiczna zwiększa również prawdopodobieństwo przecięcia obu nici DNA. Jest nawet możliwe, że dwa enzymy działają jako dimer do cięcia sekwencji palindromicznej, co jeszcze bardziej zwiększa wydajność.

Ostatni powód był ważny w walce między wirusami i bakteriami. Bakterie ewoluowały, aby „wyłączyć” wirusy ukierunkowane na bakterie (bakteriofagi) przy użyciu enzymów restrykcyjnych, które wiążą się z tymi sekwencjami palindromicznymi. Cięcie obu nici DNA szkodzi wirusowi bardziej niż cięcie jednej nici.