Jaki może być problem, jeśli zespoły nie pojawiają się w Western Blot?

Jaki może być problem, jeśli zespoły nie pojawiają się w Western Blot?
Anonim

Odpowiedź:

Wiele…

Wyjaśnienie:

Istnieje wiele powodów, dla których pasma mogą nie pojawiać się na Western blot. Czy kombinacja próbek i przeciwciał działała w przeszłości?

Poniżej przedstawiam tylko kilka, które mogę wymyślić w chwili, w której zespoły mogą się nie pojawić:

  1. Czy transfer białka z żelu? Spróbuj zabrudzić membranę czymś podobnym do ponceau S lub amidowej czerni, aby sprawdzić, czy pasma są obecne. Czasami można zobaczyć prążki białka na membranie, zwilżając je i trzymając pod kątem do światła.

  2. Czy pierwotne przeciwciało działa? Jest to trudne do przetestowania i jedynym sposobem, w jaki możesz to zrobić, jest włączenie kontroli pozytywnej, gdy wiesz, że masz białko będące przedmiotem zainteresowania. Jeśli masz jakieś białko będące przedmiotem zainteresowania, możesz spróbować je zlokalizować na błonie Western blotting (tj. Nie uruchamiasz żelu) i sprawdzasz, czy otrzymasz wynik, jeśli przetworzysz błonę tak, jakby była to Western blot.

  3. Czy wtórne przeciwciało rozpoznaje pierwszorzędowe przeciwciało? Znowu trudny do przetestowania. Jedynym testem, który możesz wykonać, jest test spot wspomniany powyżej w 2.

  4. Czy „system wykrywania” działa? W zależności od stosowanej metody wykrywania, możesz spróbować wzbogacić się w drugie przeciwciało wtórne, aby sprawdzić, czy działa roztwór wykrywający, a także czynnik wyzwalający / enzym na drugorzędowym przeciwciele. Czy można wywołać reakcję tylko drugorzędowym przeciwciałem?

Wreszcie, może to być tak proste, jak jedno z rozwiązań zastosowanych podczas sondowania fabuły, która jest nieprawidłowo tworzona. Na przykład, jeśli stężenie soli w buforze jest nieprawidłowe, może to spowodować uwolnienie przeciwciał z plamki. To samo zdarzyłoby się, gdyby pH buforów było nieprawidłowe.

„Najdziwniejszą” przyczyną niedziałającego zachodniego plamki, którego osobiście doświadczyłem, była zmiana dostawcy mleka w proszku używanego do blokowania membrany. Proszek nowego dostawcy zawiera fosfatazę fosfotyrozynową, która usuwa wszystkie grupy fosforanowe, które próbowaliśmy wykryć za pomocą naszego przeciwciała przeciw fosfotyrozynie.